O bom funcionamento dos descarregadores de fundo do Canal Condutor Principal encontra-se comprometido, em muitos deles, por obstrução das vias de drenagem. Nas recentes trovoadas ocorridas foi necessário abrir o de Carrapatas, para evacuação de água, lamas e sedimentos, tendo o caudal de cheia inundado terrenos de cultivo e provocado uma pequena derrocada num muro de contenção. O sucedido foi relatado à Direcção Geral de Agricultura e Desenvolvimento Rural para conhecimento e tomadas de decisão. Torna-se necessário poder abrir os descarregadores de fundo sempre que tecnicamente se justifique para o bom funcionamento do sistema de rega. Com o aumento da frequência de chuvas torrenciais que se tem verificado e a escorrência de materiais para o interior do canal, tal recurso será cada vez mais frequente. Apela-se aos senhores beneficiários,  proprietários ou utilizadores de terrenos em linha de água de drenagem dos descarregadores de fundo, para a necessidade de boas práticas nesta finalidade.